鱼类患病多是鱼体与其生活的水环境不协调的结果。一方面鱼体质差、抗病能力弱。另一方面，水体水质不适合鱼类生活，存在危害鱼类生活的病原体等致病因素。环境因素分为物理因素、化学因素和池塘条件三个因素。物理因素，主要为水体温度和透明度。一般随着水体温度的升高，透明度会降低，病原体的繁殖速度会加快，鱼病的发生率呈上升趋势，但是个别喜低温种类的病原体除外，如水霉菌、小型点状极毛杆菌等。化学因素也就是化学指标，通常是指水质好坏的主要指标，也是导致鱼病发生的最主要的因素。

养殖池塘中化学因素主要是溶氧量、pH值和氨态氮含量，在溶氧量充足、pH值适合和氨态氮含量比较底的时候，鱼病的发生率自然不高，反之的话就很容易发病了。比如在缺氧的时候鱼体很容易感染烂鳃病，pH值低于七时极易感染各种细菌病，氨态氮含量过高时极易发生暴发性出血病。池塘条件主要的就是指池塘的大小和底质。一般来说较小的池塘温度和水质变化都是比较大的，鱼病的发生率也会比较大池塘的高。底质为草炭质的池塘pH值一般都会比较低，有利于病原体的繁殖，导致鱼病发生率较高。

底泥厚的池塘，病原体含量高，有毒有害的化学指标一般也比较高，因而也容易发生疾病。很多的鱼病可能都是由于各种的生物传染，某些生物侵袭鱼体所导致的，这些来讲都应该算是生物因素了。很多的鱼类生病都是由于一些个微生物和寄生虫，正是由于他们在鱼类的体表或是体内寄生生活，它们就需要鱼体的营养，这样一来就会破坏鱼的组织和器官，严重的影响了鱼类的生命活动。这也就是我们通常所说的传染性疾病和寄生性疾病。

另外，还有一些生物，如水藻和水绵等，它们在池塘大量繁殖时，消耗肥料使水质变瘦，同时影响鱼类活动，也妨碍打网操作，有时甚至会把鱼网死。水蚤、鸥鸟和椎实螺等是鱼类寄生虫的宿主，对鱼病的发生影响很大。水鸟、水蛇、水生昆虫肉食性鱼类和青蛙等，这些都能直接伤害或吞食鱼类。人为因素，在精养池塘，人为因素的加入大大的加速了鱼病的发生，如放养密度过大、大量的投喂人工饲料和机械性操作等等，都会使鱼病的发生率大幅度的提高。鱼的体质因素主要为品种和体质，是鱼病发生的内在原因，也是鱼病发生的根本原因。

一般杂交的品种较纯种的抗病力强，当地品种较引进品种抗病力强。体质好的鱼类各种器官机能良好，对疾病的免疫能力和抵抗力都很强，鱼病的发生率较低。鱼类的体质也与饲料的营养密切相关，当鱼类的饲料充足，营养均衡时，鱼的体质就会比较健壮，较少得病，反之体质较差，免疫力降低，对各种病原体的抵御能力下降，极易感染发病。同时在营养不均衡时，又可直接导致各种营养性疾病的发生。有时由于拉网运输时操作不当，导致鱼体受伤严重，一时间很难恢复，导致病菌乘虚而入，使得与病发生。