鲫鱼鳃出血的病原是鲤疱疹病毒Ⅱ型，该病毒只危害鲫鱼及其变种，对池塘中的其它鱼类也具有感染性，但无致病性。携带病毒的鲫鱼早期无明显症状，病毒可以长期潜伏在鲫鱼体内，在水温升高、环境恶化和鲫鱼体质较弱时暴发，且发病迅速，死亡率高。

发病鲫鱼溜边独游、体表发黑、鳍条末端发白；病鱼捞出水面后，鳃部大量出血，眼球突出，下颌、胸鳍基部点状充血；解剖可见肝脏充血严重，腹腔内有大量黄色半透明腹水。

鳃出血刚发现时，只危害较大规格鲫鱼，100克/尾以下的鲫鱼几乎未见发病，且水温18～28℃时较为严重，水温低于18℃后逐渐停止死亡。但是近几年发现，鲫鱼种也开始暴发鳃出血，2018年发现80尾/千克的鲫鱼种暴发鳃出血，水温到12℃左右时还有一定数量的死亡，说明鳃出血病毒发生了一定的变异，鲫鱼发病规格和发病水温范围扩大，进一步加重了鲫鱼养殖的风险。

由于鳃出血的病原是病毒，目前还没有治疗病毒性疾病的特效药，因此鳃出血重点在于预防。